Müze, Güpgüpoğlu Konağı’nda yer alan Etnografya Müzesi’nin hemen karşısında yer almaktadır. İmamzade Raşit Ağa Konağı olarak bilinen ve günümüzde Atatürk Evi ve Müzesi olarak hizmet veren konak, XIX. Yüzyılda inşa edilmiş, Geç Osmanlı Dönemi’ne ait eski bir Türk evidir. Yapı, mimari özelliklerinin yanı sıra, Mustafa Kemal Paşa’nın Kayseri’de ağırlanması bakımından tarihi öneme sahiptir. Milli Mücadele Dönemi’nde 19-20 Aralık 1919 tarihinde Mustafa Kemal Paşa’nın, Heyet-i Temsiliyye adına Kayseri’ye ilk gelişlerinde bu konakta iki gece misafir edilmiştir. 1976 yılında Korunması Gerekli Taşınmaz Kültür Varlığı olarak tescil edilen konak, 1978 yılında da Kültür Bakanlığınca kamulaştırılmış ve 1983 yılında “Atatürk Evi” olarak ziyarete açılmıştır. 19 Aralık 1998 günü binanın ikinci katı tekrar düzenlenerek “Atatürk Müzesi” olarak hizmet vermeye başlamıştır. Giriş ve bodrum katında Bakanlığımıza bağlı Güzel Sanatlar Galeri Müdürlüğünün yönetim büroları ve sergi salonu yer almaktadır. Müzede 41 adet envanterlik eser sergilenmektedir. Mustafa Kemal ATATÜRK ve arkadaşlarının silikondan heykelleri yer almaktadır.